כימיה חישובית הינה תחום חדשני ומרתק שחדר בשנים האחרונות לכל ענפי הכימיה, ונודעת לה השפעה רבה במדע החומרים, הכימיה התרופתית, הביוכימיה והביופיזיקה המולקולרית. בבסיס התחום עומדת היכולת לנבא מבנים ותכונות של מולקולות, אפילו גדולות במיוחד, ובתוך כך לכוון את התחום הנסיוני תוך קבלת הערכות מדוייקות להפליא באשר לתכונות החומר. מסלול זה מציע שילוב מושלם של לימודים במדעי המחשב וכימיה ובנוי בצורה המאפשרת שילוב זה עם מינימום חפיפות במערכת השעות מבחינת קורסי חובה. המסלול מעניק ידע רחב ומעמיק בשני החוגים וגם מאפשר למי שממשיך לתואר שני לחקור נושאים מגוונים משני החוגים. בוגרי המסלול יוכלו להשתלב בכל תחומי הכימיה החישובית, כמו גם תחומים רבים אחרים בכימיה או כאלה המשלבים ידע במדעים מדויקים ובמדעי המחשב.
תלמידי המסלול מדעי המחשב כימיה מחוייבים ב 6 אבני פינה : 2 רוח, 2 חובה ו-2 רוח או חברה.
חובה במדעי המחשב 87 נ"ז
חובה בכימיה 64 נ"ז
אבני פינה:4 נ"ז
סה"כ לתואר: 155 נ"ז